OK.
Wenn du es nicht weißt, dann hast du es nicht.

Warum bei dir die Zugriffe auf die Platte jetzt so lange dauern ist schwer zu sagen. Hast du mal einen Festplattenbenchmark durchgeführt?
Zum Beispiel mit HD-Tach

Und wie sieht's im abgesicherten Modus aus? Dauert der auch so lange, bzw. dauert er länger, als er eigentlich sollte?