Über Viren auf WinMo würde ich mir keine Sorgen machen. Es gab zwar kürzlich einen Dialer, der das Telefon dazu brachte sich mitten in der Nacht mit dem Ausland zu verbinden, den musste man jedoch von Hand installieren (war getarnt als ein Spiel).
Und normale Windowsviren würden auch nicht funktionieren, da die mit absoluter Sicherheit für ARM compiliert sein müssen und Windows CE auch etwas anders aufgebaut ist wie Windows für den PC.