Ich kann mir den Editor leider im Moment nicht angucken aber ich habe eine Vermutung bzw. eine Idee. In einem Video gab es doch mal zu sehen wie einer im Editor eine Straße gebaut hat, danach einen Knopf gedrückt hat und die Heightmap hat sich angepasst. Wenn ich das richtig verstanden habe versuchst du ja quasi den Fluß im nachhinein an das Terrain anzupassen. Könntest du nicht den Fluß so bauen wie er soll und vielleicht gibt es da ja dann auch einen button der automatisch das flussbett angleicht oder so

EDIT: denke das müsste der Button "Align Height Map" sein den man auf deinem Screenshot sehen kann