Also ich würde nicht unbedingt auf nen kaputtes Bauteil tippen. Ist natürlich möglich, dass das von nem Trafo kommt aber ich halts für wahrscheinlicher, dass das Störgeräusche über den Mobo-Lautsprecher sind. Hört man öfters... z.B. auch ein kratzen im Lautsprecher im Takt der Abtastrate der Maus.
Irgendwie sind Onboard Soundchips da besonders befallen hab ich dass Gefühl. Ist aber auch nicht leicht, in nem Kasten voller verschiedenster elektronischer Bauteile und Schaltungen Induktionen oder ähnliches gänzlich auszuschliessen.
Die Lüfter sind hier als Verursacher recht wahrscheinlich. Die Sorgen mit den Spulen für einiges an Induktion.

Weiss jetzt nicht ob das Mobo neu war. Wenn ja, würd ichs einfach umtauschen. Falls du keine Garantie mehr drauf hast und der Ton doch nicht so sehr stört würd ich nichts dran machen. Wenn er aber, wie es sich anhört, so penetrant ist, dass dus nicht aushälst... Vertick das Ding bei Ebay und hol dir ein neues.