Naja, das ist halt die Reparatur-Console. Damit kann man, mit entsprechenden Kenntnissen, Systemdateien austauschen und dergleichen. Aber alles nur in sehr beschränktem Maße.
Aber du hast ja anscheinend gefunden, wie du Windows "überinstallierst". Das sollte funktionieren.
Also bei Vista ist das ganze schon etwas komfortabler gestaltet. Das erkennt automatisch fehlende Systemdateien oder z.B. zerschossene Bootsektoren und repariert dergleichen.