Ich weiß nicht, ob du's noch benötigst, aber hast du schon mal bei wikipedia nachgeschaut? Guck dir dort mal den vorletzten Weblink an.

Eventuell kannst du es auch ganz einfach mit Linux (zum Beispiel einer Knoppix) formatieren. Ich habe solche großen Partitionen zwar noch nie mit Fat32 formatiert, da das nicht besonders empfehlenswert ist, aber ich denke, dass es mit Linux funktionieren müsste.

PS:
Dann könnte ja Linux nie mit größeren Dateien als 4GB umgehen
Linux verwendet ja auch kein Fat32 Dateisystem.