Ich hab auch zwei Festplatten und auf jede ein Betriebssytem (XP und Vista), das Umstellen ist recht einfach, beim Start vom PC, also beim BIOS Start, musste einfach ne F Taste drücken (z.B. F12 oder F11, ich weis es net so genau, kommt ganz auf dein MB an

) und dann Fragt er dich welches Device du zum booten hernehmen willst. Bei der Installation ist es so, dass du einfach das Laufwerk von der Zweiten HD auswählst z.B:
Festplatte 1:
C:\ -> das ist das XP Laufwerk
D:\ (ggf.)
E:\ (ggf.)
Festplatte 2:
F:\ -> das sollte das Vista Laufwerk sein, aber eben nur wenn du die Partitionen D, und E auf der 1. Festplatte hast.

G:\ (ggf.)
H:\ (ggf.)
achja es sollten keine USB-Sticks oder USB-Festplatten bei der Installation am PC angeschlossen sein.