Kann es sein, dass du Layer deaktiviert hast, auf denen die Trackviews gespeichert waren?
Die Layer sind in der rechten Editorleiste unter dem letzten Symbol mit den farblichen Platten zu finden.

Falls sie nicht deaktiviert worden sind und sie auch in den .bak's fehlen, kann es eigentlich nur ein Bug sein. Den hatte ich auch schonmal. Alle Trackviews wurden mit einem mal gelöscht.